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    從野生稻中分離到一個新的早抽穗QTL- qHD1b

      近日,中國水稻研究所超級稻育種課題組在《作物學報(The Crop Journal)》在線發表了題為“通過上調Ehd1促進普通野生稻抽穗的QTL -qHD1b的精細定位和候選基因分析(Fine mapping and candidate gene analysis of qHD1b, a QTL that promotes flowering in common wild rice (Oryza rufipogon) by up-regulating Ehd1)”的研究論文,報道了一個源自普通野生稻的早抽穗QTL-qHD1b的精細定位和候選基因分析。

      抽穗期是決定水稻品種地區和季節適應性的重要農藝性狀,隨著耕地面積的不斷減少,培育早熟高產的水稻品種意義重大。目前,水稻中已克隆了15個抽穗期QTL,均克隆自栽培稻,鮮有報道克隆自野生稻。在栽培稻的馴化過程中,約有30-40%的遺傳變異丟失。因此,源自野生稻的自然變異,對于挖掘和克隆新的水稻抽穗期QTL提供了重要的遺傳資源。

      研究者利用以中恢8015(ZH8015)為背景,將攜帶普通野生稻片段并表現為早抽穗的滲入系IL7391與ZH8015雜交,產生BC5F2:3家系進行QTL分析。從中鑒定出兩個抽穗期 QTL,qHD1b和qHD7,并選擇前一個進行進一步研究。利用BC5F4:5和BC5F6群體進行高分辨率連鎖分析,將qHD1b定位于第1染色體短臂上112.7-kb的區間內,包含17個預測基因,其中5個在啟動子或編碼區含有多態的基因被認為是候選基因。表達分析顯示LOC_Os01g11940的表達與早抽穗呈正相關,該位點被注釋為OsFTL1,編碼擬南芥FT的同源基因,是qHD1b最可能的候選基因。抽穗期相關基因表達分析發現,在短日照和長日照條件下,qHD1b作為開花激活因子,通過上調Ehd1、Hd3a、RFT1、OsMADS14和OsMADS15促進抽穗。田間試驗表明,qHD1b對千粒重和粒長等產量相關農藝性狀均有影響。qHD1b可用于進行早熟品種的分子標記輔助選擇育種。

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